上海市第九人民医院（上海交通大学医学院附属第九人民医院）的前身“伯特利医院”创建于1920年。1952年更名为上海第九人民医院，1984年正式成为上海第二医科大学附属第九人民医院(以下简称“九院”)，2005年上海第二医科大学与上海交通大学正式合并，九院改名为上海交通大学医学院附属第九人民医院。

九院是一所以口腔、整复外科和骨科为特色的内、外、妇、儿各科齐全的专业综合性教学医院。近年来，以“精修医术、诚炼医德、广纳贤才、齐铸九院”的医院精神，以“科教兴院、专业人士强院”的发展战略，在医、教、研、管理等方面取得了可喜成绩。已连续十届评为上海市文明单位，并获“城市医院文化建设专业集体”。

医院拥有3 个上海市临床医学中心(口腔临床、整复外科、关节外科)和2个上海市临床医疗质 量控制中心(口腔医学、医学美容)。口腔临床医学、整复外科与组织工程学、外 科学(骨科)现为国家重点学科，口腔基础医学现为国家重点培育学科。2009年教育部学位与研究生学位发展中心公布的2007～2009学科评估高校排名结果，上海交通大学口腔医学以80分与北京大学并列排名第二。口腔医学、整复外科学、骨科学为教育部第三期“211工程”重点建设学科。口腔黏膜病科列为国家中医药管理局重点专科。组织工程学为上海市“重中之重“学科，口腔颌面外科为上海市重点学科(优势学科)，口腔修复生物材料学为上海市重点学科(特色学科)，口腔基础医学和眼科学为上海市第三期重点学科，骨科为上海市教委重点学科。眼科、麻醉科、泌尿外科、内分泌科为上海交通大学医学院重点学科。也是上海交通大学医学院血管病诊治中心、疝与腹壁外科疾病诊治中心单位。

九院是上海交通大学口腔医学院、九院临床医学院教学基地，拥有27个教研室，建立了一流的口腔仿真模头实训基地。获得3项国家级精品课程，1项国家级双语教学示范课程，1个国家级教学团队，硕士234名，博士74名，设有3个博士后流动站，15个博士点、20个硕士点。医院现有1个国家组织工程研发中心，1个教育部数字医学工程研究中心，上海市组织工程重点实验室、上海市口腔医学重点实验室和上海市骨科内植物重点实验室。拥有上海市整复外科医院、上海市口腔医学医院、上海市生物材料研究测试中心和上海交通大学眼科视觉科学觉医院。上海市科技功臣1人，上海市十大科技精英2人。有国家青年2人，长江学者3人，中组部千人计划1人，上海市委组织部千人计划1人，新世纪百千万工程国家级人选2人、教育部新世纪优秀专业人士支持计划5人、卫生部专业贡献中青年医师4人，以及上海市启明星(后)计划等市级以上专业人士培养近100人次。近十年来医院承担纵向科研项目500多项，其中包括其中973首席科学家项目2项，国家自然科学基金170项(重点项目3项)。获国家级奖项3项(国家科技发明二等奖1项、国家科技进步二等奖2项)，省部级奖项52项(其中一等奖7项)、上海市卫生系统银蛇奖一等奖1项。近5年，科研总经费约16000多万元，发表论文3000余篇，其中SCI收录论文260余篇。2004年度Medline收录论文数量居医疗机构排名第1位。科学技术信息医院公布的2008年度科技论文统计结果，该院被SCI收录论文数达90篇，排名医疗机构第17位，2010年“表现不俗”SCI论文第20位。2009年复旦大学管理医院最佳医院排行榜列17位，整形外科第1位，口腔科第3位。

该院连续九届评为上海市文明单位，并获“城市医院文化建设专业集体”。获国家级奖项3项(国家科技发明二等奖1项、国家科技进步二等奖2项)，省部级奖项39项(其中一等奖6项)、上海市卫生系统银蛇奖一等奖1项。先后获得城市医院“思想政治工作专业集体”、城市医院“抗震救灾专业集体”。口腔颌面外科荣获总工会授予的“五一劳动奖状”、首届“工人先锋号”、上海市“工人先锋号”。